Diplômé de l'École Polytechnique et de l'ENSAE, Éric Dubois est conseiller maître à la Cour des comptes, à la première chambre, et rapporteur général du rapport annuel sur la situation et les perspectives des finances publiques.
Il a précédemment exercé de nombreuses responsabilités, notamment à la commission des comptes et des budgets économiques de la nation, au conseil d'analyse économique, à la direction de la sécurité sociale (sous-directeur de la prévision et des études financières), à la direction générale du Trésor (sous-directeur des prévisions macroéconomiques) et à l'Insee (directeur des études et synthèses économiques).